O Museu da Cidade de Kobe possui quase 70.000 objetos, incluindo um Tesouro Nacional composto por 21 itens e seis importantes Ativos Culturais com 74 itens. Eles estão divididos nas seguintes categorias gerais: artefatos arqueológicos, incluindo sinos de bronze e alabardas de bronze descobertas em Sakuragaoka; quase 7.000 objetos de arte, incluindo gravuras em xilogravura coloridas do final do século 19 e obras no estilo Namban, incluindo “Reis Equestres da Europa” coletados por Hajime Ikenaga e “Retrato de São Francisco Xavier”; quase 8.000 mapas antigos e materiais geográficos coletados por Matsutaro Namba e Takejiro Akioka, entre os quais muitos mapas produzidos no Japão e no exterior, como o “Pequeno Mapa do Japão por (Tadataka) Ino” e “Japan Atlas Byobu”; e documentos e artefatos históricos relacionados a Kobe. Alguns objetos de arte e mapas antigos podem ser exibidos apenas por um tempo limitado devido a razões relacionadas à preservação.