A rápida industrialização na Coréia destruiu e poluiu a natureza e o meio ambiente, levando à extinção de muitos seres vivos. Existe uma necessidade urgente de um estabelecimento que colete, preserve e exiba nossa propriedade natural. Assim, o escritório do distrito de Seodaemun decidiu estabelecer um museu abrangente de história natural como parte de sua estratégia de desenvolvimento local para desenvolver Seodaemun como um centro de educação e cultura, bem como para satisfazer as necessidades culturais do cidadão. Após 6 anos de planejamento e construção, o museu foi inaugurado em 10 de julho de 2003.