Em 1993, autoridades da Guatemala prenderam Guzmán no México, onde foi condenado e sentenciado à prisão de segurança máxima por 20 anos. Porém, mesmo por trás das grades, El Chapo mantinha seu poder: por meio de subornos, conseguia direito à visitas íntimas e conseguia manter seus negócios em funcionamento. Sua figura já tinha efeito mítico no México, uma vez que muitos distritos o consideravam como um Robin Hood, pois ajudava muito as comunidades carentes. Sua lenda cresceu quando, em 2001, com a ajuda de guardas na prisão, fugiu dentro de um carrinho com produtos para limpeza. Mais tarde, uma investigação federal levou à prisão 71 funcionários da prisão, incluindo o diretor.

O controle de El Chapo só se enrijecia, expandindo suas fortunas cada vez mais. Em 2009, foi alegado que Sinaloa gerava 3 Bilhões de dólares por ano, o que colocou o chefão no número 701no ranking de pessoas mais ricas do mundo, da revista Forbes. Isto também o colocou como inimigo número 1 do governo norte-americano, que ofereceu 5 milhões de dólares em recompensa por informações que levassem à sua prisão.

Uma operação mais agressiva sobre os cartéis se iniciou pelo governo do México em 2006, porém, fracassou na tentativa de pegar Guzmán que transitava livremente em seu país, inclusive se casou neste tempo, realizando a celebração com uma grande festa, contando com policiais e políticos entre os convidados. Estima-se que Guzmán se casou pelo menos três vezes e é pai de 13 filhos.

Em Fevereiro de 2014, Guzmán foi finalmente preso em um hotel no Pacífico, em uma praia na cidade de Mazatlán, no México. Em recusa à extradição do chefe aos EUA, o presidente mexicano Enrique Peña Nieto jurou que El Chapo nunca mais escaparia novamente. A ironia se deu 18 meses depois, quando Joaquín Loera orquestrou uma fuga aérea muito ousada da prisão em julho de 2015. Para isto, ele saiu por uma abertura feita no chão da seção de chuveiro de sua cela, desceu por uma escada de 30 degraus e saiu por um túnel, que conectava sua cela a uma casa, ainda em construção, a uma milha de distância da prisão.

Em 17 de Outubro de 2015, Guzmán teve ferimentos em seu rosto e perna enquanto escapava dos militares, nas montanhas do noroeste do México. Mais ou menos ao mesmo tempo, sem o conhecimento do resto do mundo, conduziu uma audaciosa entrevista secreta para o ator Sean Penn e a atriz mexicana Kate del Castillo, à qual havia sido contatada para fazer um filme sobre a vida de Chapo. Confira a entrevista abaixo, para quem consegue arriscar um portuñol e não sabe inglês, dá pra entender boa parte, saca só!

Extradição aos EUA

Em 8 de Janeiro de 2016, o presidente mexicano Enrique Peña Nieto anunciou no Twitter que as autoridades mexicanas haviam capturado novamente Guzmán após um tiroteio na manhã, na cidade de Los Mochis. Sua mensagem dizia “Missão completa, nós o pegamos”.

A prisão do chefão aconteceu um dia antes de sua entrevista com Penn ser publicada pelo site da Rolling Stone. Não está claro se a comunicação com o ator colaborou para sua captura, porém as autoridades revelam que monitoraram atividades por meios eletrônicos, o que ajudou no processo. Guzmán retornou à prisão da qual fugiu no verão anterior. Depois, foi movido para uma penitenciária próxima à fronteira com os Estados Unidos em Juarez, México. Em Outubro de 2016, Vicente Bermudez Zacarias, o juiz que cuidava do caso de Guzmán, foi assassinado perto de sua casa.

Em janeiro de 2017, o governo mexicano extraditou El Chapo para os Estados Unidos, sob acusações como tráfico, lavagem de dinheiro, dentre outras. O chefe foi julgado na Corte Federal dos EUA em Brooklyn, Nova York, e alegou inocência sobre todas as acusações. Em maio de 2018, um dos advogados de Guzmán pediu ao juiz para mover o processo para Manhattan, o qual é diretamente ligado à prisão de segurança máxima onde o réu está. O juiz acatou o pedido, uma vez que a Corte de Brooklyn exigiam maior proximidade do julgado, para assegurar sua passagem pelo Rio do Leste.